More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3360 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  100 
 
 		 505 aa  1022    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  56.32 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  51.73 
 
 		 501 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  41.87 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  38.48 
 
 		 527 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  38 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  39.14 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  38.31 
 
 		 530 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  37.8 
 
 		 531 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  36.66 
 
 		 528 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  37.13 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  37.62 
 
 		 528 aa  310  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  38.22 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  37.77 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  36.4 
 
 		 519 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  35.64 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  38.78 
 
 		 553 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  35.38 
 
 		 521 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  38.26 
 
 		 527 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  38.09 
 
 		 526 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  36.72 
 
 		 524 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  37.82 
 
 		 531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  38.26 
 
 		 517 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  38.17 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  35.92 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  35.8 
 
 		 524 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  36.02 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  37.05 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  36.72 
 
 		 532 aa  280  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  33.13 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  36.81 
 
 		 521 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  34.95 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  37.45 
 
 		 515 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  35.81 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  38.09 
 
 		 550 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  34.99 
 
 		 554 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 539 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 543 aa  239  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 545 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 542 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 546 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  33.07 
 
 		 547 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  32.04 
 
 		 567 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  30.48 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 553 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  34.31 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  32.92 
 
 		 539 aa  217  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  34.06 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 548 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  34.14 
 
 		 4575 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 551 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  29.38 
 
 		 542 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 542 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 537 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  32.97 
 
 		 517 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 5154 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.88 
 
 		 558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  33.13 
 
 		 541 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.38 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.44 
 
 		 567 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12962  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 705 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 538 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.13 
 
 		 541 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  27.48 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 546 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.13 
 
 		 541 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2934  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.58 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  33.4 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 532 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 561 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2490  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 581 aa  186  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0748983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 532 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1058  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.599602  normal  0.879487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>