More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0875 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0391  AMP-dependent synthetase and ligase  71.51 
 
 		 510 aa  674    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.552309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5458  AMP-dependent synthetase and ligase  73.85 
 
 		 513 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 517 aa  1018    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0346  AMP-dependent synthetase and ligase  71.91 
 
 		 510 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913385  normal  0.868784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  86.07 
 
 		 513 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0425  AMP-dependent synthetase and ligase  72.48 
 
 		 512 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  64.1 
 
 		 526 aa  631  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  53.45 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1346  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0953  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386047  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1556  putative ATP-dependent AMP-binding enzyme  44.55 
 
 		 519 aa  313  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493299  normal  0.349479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2315  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 478 aa  278  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 537 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 530 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.26 
 
 		 586 aa  256  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 530 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 571 aa  249  9e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 609 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.41 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 560 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 616 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  30.86 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  31.11 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.86 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.86 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 567 aa  240  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  30.86 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  30.86 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  30.86 
 
 		 522 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  34.92 
 
 		 526 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  34.02 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 552 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 551 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.77 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  34.92 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 514 aa  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.58 
 
 		 524 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  30.51 
 
 		 563 aa  228  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  32.52 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 549 aa  223  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 525 aa  223  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  32.77 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  35.28 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 559 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 559 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 561 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 532 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.18 
 
 		 563 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 576 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 546 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  33.27 
 
 		 571 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  28.68 
 
 		 571 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  32.58 
 
 		 532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 571 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 532 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  32.95 
 
 		 515 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.09 
 
 		 534 aa  213  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  32.33 
 
 		 549 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  28.82 
 
 		 550 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  32.64 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 547 aa  211  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 526 aa  211  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 562 aa  210  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 		 569 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  33.71 
 
 		 550 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  29.7 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 593 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  31.51 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>