More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3244 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 506 aa  1006    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  53.89 
 
 		 526 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  53.68 
 
 		 517 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5458  AMP-dependent synthetase and ligase  52.36 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  53.25 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0425  AMP-dependent synthetase and ligase  52.75 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0346  AMP-dependent synthetase and ligase  51.28 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913385  normal  0.868784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0391  AMP-dependent synthetase and ligase  51.48 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.552309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0953  AMP-dependent synthetase and ligase  45.61 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386047  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1346  AMP-dependent synthetase and ligase  43.86 
 
 		 502 aa  362  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1556  putative ATP-dependent AMP-binding enzyme  46.67 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493299  normal  0.349479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2315  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 537 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 530 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 530 aa  233  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  32.25 
 
 		 527 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  29.4 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 528 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  29.59 
 
 		 528 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  29.79 
 
 		 528 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  29.59 
 
 		 528 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  29.79 
 
 		 528 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 522 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 528 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 528 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 528 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.19 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 537 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 541 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 555 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  33.46 
 
 		 526 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  32.33 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  32.33 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  32.33 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  32.33 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  32.33 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  31.82 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  33.73 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  32.14 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  34.16 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 616 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  31.52 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  32.76 
 
 		 528 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  32.4 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  32.14 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  35.63 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.16 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 529 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  31.86 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 609 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 539 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 549 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.23 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 576 aa  193  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 507 aa  193  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  28.89 
 
 		 571 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  31.68 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 539 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 544 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  31.5 
 
 		 527 aa  191  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  29.18 
 
 		 572 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  31.19 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 517 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  31.74 
 
 		 550 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 559 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  30.66 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  31.81 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  33.98 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  27.19 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  31.03 
 
 		 554 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 571 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.2 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>