More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1370 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  87.43 
 
 		 517 aa  860    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5458  AMP-dependent synthetase and ligase  73.41 
 
 		 513 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0391  AMP-dependent synthetase and ligase  71.99 
 
 		 510 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.552309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0346  AMP-dependent synthetase and ligase  72.02 
 
 		 510 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913385  normal  0.868784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  64.09 
 
 		 526 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0425  AMP-dependent synthetase and ligase  72.21 
 
 		 512 aa  690    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 513 aa  1023    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  53.85 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1346  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0953  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 		 487 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386047  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1556  putative ATP-dependent AMP-binding enzyme  44.44 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493299  normal  0.349479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2315  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 478 aa  283  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 537 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  35.47 
 
 		 528 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 530 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  34.59 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  35.27 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 571 aa  247  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  34.92 
 
 		 531 aa  246  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.89 
 
 		 586 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 560 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.1 
 
 		 528 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 567 aa  243  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.9 
 
 		 524 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  30.2 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  30.14 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.14 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.14 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  32.84 
 
 		 527 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  30.14 
 
 		 528 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  30.14 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  30.14 
 
 		 522 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.84 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 528 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.09 
 
 		 514 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  36.43 
 
 		 503 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 566 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 552 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 512 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 616 aa  230  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 539 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 539 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 535 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  32.38 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  32.45 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  31.21 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  32.76 
 
 		 515 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 551 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  33.01 
 
 		 519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 520 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  32.44 
 
 		 530 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 506 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  31.78 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  28.46 
 
 		 550 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  33.15 
 
 		 553 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 662 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 521 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  31.23 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.13 
 
 		 508 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 559 aa  216  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  31.36 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  31.17 
 
 		 563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  32.05 
 
 		 571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  31.47 
 
 		 530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 565 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 5154 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 559 aa  213  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  30.9 
 
 		 533 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 563 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  29.76 
 
 		 582 aa  213  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  33.13 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  32.5 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 508 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  32.25 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 571 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>