More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0425 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0391  AMP-dependent synthetase and ligase  90.02 
 
 		 510 aa  855    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.552309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  72.21 
 
 		 513 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0346  AMP-dependent synthetase and ligase  89.82 
 
 		 510 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913385  normal  0.868784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  72.51 
 
 		 517 aa  703    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0425  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1025    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5458  AMP-dependent synthetase and ligase  77.36 
 
 		 513 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  61.23 
 
 		 526 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  52.64 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1346  AMP-dependent synthetase and ligase  40.97 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0953  AMP-dependent synthetase and ligase  42.92 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386047  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1556  putative ATP-dependent AMP-binding enzyme  42.52 
 
 		 519 aa  319  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493299  normal  0.349479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2315  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 530 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.51 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  34.98 
 
 		 526 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  29.84 
 
 		 522 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  29.78 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  29.84 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  33.2 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  30.04 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 528 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  29.84 
 
 		 522 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 528 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 528 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.1 
 
 		 528 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 551 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 535 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.82 
 
 		 514 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  34.03 
 
 		 531 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 560 aa  240  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  34.48 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 567 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 566 aa  236  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 549 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.14 
 
 		 524 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 563 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 555 aa  233  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  32.45 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  32.63 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 529 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  30.57 
 
 		 563 aa  230  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 524 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 539 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 539 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  32.39 
 
 		 549 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 548 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 616 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  35.88 
 
 		 562 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.86 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  32.07 
 
 		 532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 559 aa  226  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 552 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  33.4 
 
 		 542 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 557 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  32.23 
 
 		 571 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 559 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 559 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  29.59 
 
 		 571 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  32.44 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  32.39 
 
 		 535 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  32.69 
 
 		 521 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  29.72 
 
 		 582 aa  219  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  32.44 
 
 		 519 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  33.46 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  32 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  32.13 
 
 		 587 aa  217  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  28.57 
 
 		 550 aa  217  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2808  putative acetyl-coenzyme A synthetase  34.05 
 
 		 581 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 543 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  29.01 
 
 		 571 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  33.72 
 
 		 515 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 552 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 548 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  32.21 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 539 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 571 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>