More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2315 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2315  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 478 aa  954    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0953  AMP-dependent synthetase and ligase  52.71 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386047  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1556  putative ATP-dependent AMP-binding enzyme  50.41 
 
 		 519 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493299  normal  0.349479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1346  AMP-dependent synthetase and ligase  44.22 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 513 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5458  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 513 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 517 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0391  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 510 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.552309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0425  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 512 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0346  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913385  normal  0.868784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  30.12 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.19 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  29.31 
 
 		 524 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  28.87 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  27.49 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  27.97 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  28.43 
 
 		 518 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  25.45 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  29.05 
 
 		 539 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  27.24 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  27.35 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  31.1 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  27.67 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  27.12 
 
 		 527 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  30.04 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  26.92 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  27.66 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.02 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  28.21 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  28.49 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  26.55 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  28.27 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  28.17 
 
 		 549 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  27.98 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 557 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  26.59 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  28.65 
 
 		 533 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  27.54 
 
 		 553 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  27.33 
 
 		 528 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 549 aa  153  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  28.4 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 528 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 508 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  27.09 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0669  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 560 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  27.47 
 
 		 512 aa  150  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  25.33 
 
 		 586 aa  150  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  25.24 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 567 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 		 571 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  25.19 
 
 		 523 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  25.49 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  25.66 
 
 		 609 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  29.31 
 
 		 541 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  27.83 
 
 		 547 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 573 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 542 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 528 aa  143  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 		 552 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  29.31 
 
 		 541 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.1 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 566 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  29.9 
 
 		 567 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  29.46 
 
 		 541 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  27.83 
 
 		 554 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.05 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  24.42 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  25.56 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  29.23 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 568 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  28.79 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 568 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.85 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>