More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0589 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  73.97 
 
 		 542 aa  817    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  80.93 
 
 		 542 aa  913    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  100 
 
 		 547 aa  1124    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  57.14 
 
 		 553 aa  611  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  57.35 
 
 		 548 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  57.65 
 
 		 539 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  55.15 
 
 		 545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  55.99 
 
 		 546 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  55.05 
 
 		 546 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  56.26 
 
 		 538 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  56.26 
 
 		 538 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  55.14 
 
 		 539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  54.5 
 
 		 546 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  52.25 
 
 		 543 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  51.51 
 
 		 546 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  51.49 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  50.66 
 
 		 542 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 		 539 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  49.44 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  47.49 
 
 		 557 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  49.06 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  46.73 
 
 		 546 aa  475  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  45.84 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 		 539 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  48.05 
 
 		 538 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 		 551 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  47.57 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  47.57 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  47.57 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 546 aa  364  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  36.49 
 
 		 528 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  33.92 
 
 		 523 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  35.02 
 
 		 527 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  34.63 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  33.85 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  36.48 
 
 		 526 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  32.67 
 
 		 525 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  33.01 
 
 		 553 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  36.21 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  36.51 
 
 		 521 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  35.43 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  35.11 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  36.88 
 
 		 531 aa  274  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  37.14 
 
 		 527 aa  272  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  35.43 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.74 
 
 		 528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  36.87 
 
 		 532 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  35.31 
 
 		 503 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  35.45 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  35.43 
 
 		 524 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  34.17 
 
 		 535 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  35.34 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  34.17 
 
 		 524 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  34.82 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  34.62 
 
 		 531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 550 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  36.91 
 
 		 518 aa  253  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 530 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  33.73 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  34.8 
 
 		 530 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  34.7 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.73 
 
 		 524 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  30.95 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  31.07 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 537 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 537 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.58 
 
 		 528 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.38 
 
 		 528 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  30.45 
 
 		 522 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 528 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 528 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  30.66 
 
 		 522 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  32.53 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  30.67 
 
 		 528 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.45 
 
 		 528 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  31.41 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 576 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  31.8 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 551 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  32.39 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  30.98 
 
 		 563 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  31.94 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 595 aa  220  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  30.34 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 603 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>