More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6948 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  100 
 
 		 535 aa  1089    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  43.77 
 
 		 541 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  40.73 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  39.81 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  39.61 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  41.51 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  39.38 
 
 		 519 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  39.57 
 
 		 532 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  40.9 
 
 		 530 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  41.13 
 
 		 528 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  39.88 
 
 		 531 aa  349  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  40.08 
 
 		 524 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  40.08 
 
 		 528 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  39.2 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  39.36 
 
 		 527 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  39.41 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  41.54 
 
 		 515 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  39.61 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  40.08 
 
 		 530 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  38.3 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  38.72 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  40.2 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  38.9 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  38.8 
 
 		 539 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  38.63 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  37.96 
 
 		 521 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  38.93 
 
 		 521 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  38.78 
 
 		 553 aa  326  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 537 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  40.04 
 
 		 518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  37.4 
 
 		 520 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  39.85 
 
 		 550 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  38.01 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  37.13 
 
 		 517 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  35.73 
 
 		 513 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  36.77 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  36.96 
 
 		 503 aa  293  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  36.06 
 
 		 503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 557 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 546 aa  270  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  34.17 
 
 		 547 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 538 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 529 aa  256  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 542 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  32.88 
 
 		 567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  32.27 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  33.4 
 
 		 539 aa  248  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 546 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 539 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 545 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 538 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 538 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  33.33 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 505 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 546 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  32.06 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 595 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.66 
 
 		 514 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 576 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 552 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  31.77 
 
 		 541 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  31.58 
 
 		 541 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  31.58 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 577 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 549 aa  209  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 		 512 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.98 
 
 		 500 aa  206  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 539 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 662 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 578 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  28.08 
 
 		 528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  28.08 
 
 		 528 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>