More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5523 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  72.28 
 
 		 541 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  73.5 
 
 		 541 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  72.1 
 
 		 541 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 551 aa  1133    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  98.91 
 
 		 551 aa  1124    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  72.28 
 
 		 541 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  53.23 
 
 		 539 aa  570  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  54.14 
 
 		 539 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  53.2 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  53.2 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  51.67 
 
 		 567 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  55.74 
 
 		 539 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  50.74 
 
 		 546 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 548 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  51.01 
 
 		 553 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  51.13 
 
 		 543 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  49.53 
 
 		 542 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  49.17 
 
 		 545 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 546 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  49.54 
 
 		 546 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  49.07 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  48.98 
 
 		 542 aa  485  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  47.92 
 
 		 546 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  47.29 
 
 		 557 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  48.58 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  48.31 
 
 		 547 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  45.98 
 
 		 538 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  34.81 
 
 		 525 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  34.5 
 
 		 528 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  34.22 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  35.95 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 523 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  36.97 
 
 		 519 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  33.72 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  33.52 
 
 		 528 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  34.63 
 
 		 503 aa  246  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  35.48 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  33.58 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  35.43 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  34.23 
 
 		 549 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  34.7 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  34.97 
 
 		 533 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 		 524 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  35.4 
 
 		 518 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  34.04 
 
 		 518 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.65 
 
 		 524 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  33.75 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  33.98 
 
 		 553 aa  230  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 537 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  33.87 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  33.77 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 511 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  34.84 
 
 		 526 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  31.65 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  34.21 
 
 		 524 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 548 aa  226  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 530 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  32.94 
 
 		 515 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.2 
 
 		 586 aa  224  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  31.84 
 
 		 531 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  32.24 
 
 		 535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  32.18 
 
 		 554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  31.39 
 
 		 528 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  34.1 
 
 		 527 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  30.98 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  31.19 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  31.19 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  31.19 
 
 		 522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  31.99 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  29.61 
 
 		 531 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 508 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  30.98 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  30.42 
 
 		 528 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  30.98 
 
 		 528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.98 
 
 		 528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 555 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  29.31 
 
 		 568 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  29.31 
 
 		 568 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  28.63 
 
 		 571 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 528 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 571 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  32.34 
 
 		 549 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  32.36 
 
 		 503 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  32.49 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>