More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3175 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  73.73 
 
 		 539 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  71.43 
 
 		 538 aa  777    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  71.43 
 
 		 538 aa  777    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  60.34 
 
 		 567 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  66.6 
 
 		 539 aa  714    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  61.18 
 
 		 553 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1092    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  59.93 
 
 		 548 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  59.56 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  59.93 
 
 		 543 aa  624  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  57.88 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  57.33 
 
 		 542 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  57.9 
 
 		 545 aa  611  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  57.51 
 
 		 546 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  58.24 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  57.09 
 
 		 541 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  57.3 
 
 		 542 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  54.97 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  56.9 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  56.72 
 
 		 541 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  56.72 
 
 		 541 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  55.74 
 
 		 551 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  55.93 
 
 		 551 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 		 529 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  55.43 
 
 		 547 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  55.39 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  54.65 
 
 		 546 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  54.39 
 
 		 546 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  53.33 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  52.76 
 
 		 539 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  37.07 
 
 		 528 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  36.29 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  33.46 
 
 		 525 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  33.91 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  36.58 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  39.24 
 
 		 550 aa  286  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  33.4 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  36.73 
 
 		 517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  35.91 
 
 		 533 aa  283  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  35.16 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  36.82 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  35.19 
 
 		 528 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  38.22 
 
 		 515 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  37.19 
 
 		 519 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  37.47 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 537 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  36.38 
 
 		 531 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  36.35 
 
 		 518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  36.33 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  37.19 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 539 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 539 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  35.55 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  36.53 
 
 		 532 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  35.05 
 
 		 503 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.53 
 
 		 524 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  34.24 
 
 		 535 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  33.33 
 
 		 530 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  34.77 
 
 		 503 aa  249  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  34.85 
 
 		 501 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  33.76 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  34.09 
 
 		 531 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 530 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  30.67 
 
 		 586 aa  246  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  33.12 
 
 		 531 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  33.4 
 
 		 513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  34.16 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 548 aa  243  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 609 aa  243  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  31.86 
 
 		 572 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 567 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  31.67 
 
 		 572 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  30.9 
 
 		 568 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  30.9 
 
 		 568 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  31.04 
 
 		 521 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  31.67 
 
 		 572 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 572 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  30.71 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 572 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  33.13 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 572 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 537 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 572 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 551 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  30.77 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>