More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7498 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 537 aa  1097    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  65.3 
 
 		 554 aa  713    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  44.79 
 
 		 527 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  43.84 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  40.39 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  40.08 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  40.19 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  40.5 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  41.01 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  41.23 
 
 		 528 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  41.33 
 
 		 526 aa  359  8e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  39.96 
 
 		 549 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  40.89 
 
 		 531 aa  356  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  39.96 
 
 		 533 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  40.43 
 
 		 521 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  41.43 
 
 		 517 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  40.04 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  37.8 
 
 		 532 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  38.8 
 
 		 531 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  39.42 
 
 		 524 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  38.94 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  40.66 
 
 		 518 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  39.81 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  38.36 
 
 		 530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  39.88 
 
 		 550 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  38.42 
 
 		 530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  38.79 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  38.99 
 
 		 519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  40.58 
 
 		 518 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  38.51 
 
 		 503 aa  335  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  37.6 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  38.33 
 
 		 527 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  37.28 
 
 		 513 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  39.17 
 
 		 520 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  37.48 
 
 		 521 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  38.94 
 
 		 539 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  34.08 
 
 		 541 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  36.72 
 
 		 503 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  35.19 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  33.78 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 557 aa  263  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  32.69 
 
 		 567 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 539 aa  259  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 546 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 542 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 543 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  33.4 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 529 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 542 aa  249  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 553 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  32.43 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 548 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 551 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  36.29 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 551 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 546 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  32.88 
 
 		 541 aa  232  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 537 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  31.88 
 
 		 546 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 512 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  33.75 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  33.83 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 530 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.72 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 539 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 616 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.53 
 
 		 541 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.53 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.39 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.85 
 
 		 577 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.85 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.85 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.16 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 567 aa  217  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 560 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 572 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  31.45 
 
 		 528 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 506 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 549 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 528 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 522 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  31.25 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>