More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3119 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  100 
 
 
485 aa  989    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  56.65 
 
 
501 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  57.06 
 
 
501 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  56.45 
 
 
506 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  54.75 
 
 
504 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  54.6 
 
 
503 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  54.95 
 
 
504 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  57.06 
 
 
507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  54.12 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  54.44 
 
 
504 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  55.11 
 
 
510 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  57.74 
 
 
509 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  55.69 
 
 
510 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  55.95 
 
 
511 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  55.02 
 
 
503 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  54.51 
 
 
510 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  56.66 
 
 
508 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  54.33 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  57.83 
 
 
507 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  53.35 
 
 
503 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  54.22 
 
 
506 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  54.75 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  57.81 
 
 
509 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  53.88 
 
 
505 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  55.86 
 
 
504 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  54.37 
 
 
501 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  57.75 
 
 
503 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  54.09 
 
 
504 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  51.7 
 
 
518 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  52.02 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  52.24 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  51.01 
 
 
517 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  51.5 
 
 
526 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  50.41 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  52.1 
 
 
536 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  51.27 
 
 
506 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  50.81 
 
 
517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  48.88 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  51.89 
 
 
519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  51.68 
 
 
519 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  49.9 
 
 
547 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  50.61 
 
 
500 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  49.32 
 
 
539 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  49.28 
 
 
510 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  49.9 
 
 
530 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  42.27 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  42.89 
 
 
504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
559 aa  282  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
561 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 
507 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
553 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
506 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
569 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
539 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
510 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
508 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  40.76 
 
 
480 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
492 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
508 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 
499 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  36.9 
 
 
508 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
566 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.98 
 
 
513 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
525 aa  256  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
521 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 
499 aa  256  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 
520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 
514 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
505 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
513 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 
557 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
495 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
662 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 
512 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 
506 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 
518 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.68 
 
 
500 aa  250  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
584 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 
522 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
512 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 
561 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 
498 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
508 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
510 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  39.45 
 
 
510 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32 
 
 
561 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 
582 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35 
 
 
516 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.25 
 
 
515 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 
582 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.2 
 
 
561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 
563 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 
563 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 
563 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
518 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 
510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
577 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>