More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1330 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  70.2 
 
 
493 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  70 
 
 
493 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
502 aa  1024    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  60.04 
 
 
498 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 
495 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  46.98 
 
 
533 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  39.73 
 
 
536 aa  335  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 
502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  37.28 
 
 
512 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
553 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  38.37 
 
 
518 aa  300  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 
507 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 
504 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  36.53 
 
 
505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  36.59 
 
 
508 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  35.69 
 
 
506 aa  283  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  35.75 
 
 
526 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  35.65 
 
 
503 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  35.23 
 
 
510 aa  279  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  35.9 
 
 
536 aa  279  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  34.87 
 
 
519 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  36.62 
 
 
507 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  35.92 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  34.87 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  34.67 
 
 
519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  35.96 
 
 
507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  35.59 
 
 
506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  34.76 
 
 
506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  34.55 
 
 
511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  34.84 
 
 
517 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  35.1 
 
 
504 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  37.16 
 
 
503 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
507 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  35.77 
 
 
504 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  40.05 
 
 
480 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  35.7 
 
 
510 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  34.27 
 
 
530 aa  269  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  34.96 
 
 
504 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  35.9 
 
 
510 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  34.62 
 
 
511 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  34.9 
 
 
504 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  34.79 
 
 
539 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  35.95 
 
 
504 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  36.71 
 
 
510 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  34.49 
 
 
510 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  34.3 
 
 
504 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  33.65 
 
 
503 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  33.74 
 
 
503 aa  261  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  34.07 
 
 
507 aa  260  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  36.84 
 
 
517 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  34.18 
 
 
500 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  35.03 
 
 
509 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  34.93 
 
 
501 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  33.93 
 
 
547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  35.01 
 
 
501 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  33.6 
 
 
504 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03417  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01530)  35.25 
 
 
634 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal  0.046115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 
478 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 
512 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
499 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 
472 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 
450 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  37.31 
 
 
469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
500 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.66 
 
 
514 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 
584 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.66 
 
 
510 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06766  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 
579 aa  239  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.9618  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 
520 aa  239  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.66 
 
 
510 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
498 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.22 
 
 
510 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 
510 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 
510 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
490 aa  238  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
501 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.22 
 
 
510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  35.57 
 
 
469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.08 
 
 
561 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 
468 aa  233  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
521 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
512 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  40.4 
 
 
472 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.88 
 
 
510 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.21 
 
 
582 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 
561 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 
561 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 
499 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 
532 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.91 
 
 
561 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
662 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 
561 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>