More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6317 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6317  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 509 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  59.06 
 
 		 504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  55.13 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.775156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3272  AMP-dependent synthetase and ligase  56.44 
 
 		 504 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  27.5 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1087  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3736  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 599 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  27.39 
 
 		 559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 605 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.5 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.59 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.18 
 
 		 610 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.17 
 
 		 610 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 599 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 599 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 633 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  24.78 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 622 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 604 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.33 
 
 		 563 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 602 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 604 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 555 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.46 
 
 		 610 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 546 aa  143  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 604 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 		 600 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  26.16 
 
 		 607 aa  143  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  25.35 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  26.29 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  27.27 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 		 609 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.59 
 
 		 580 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 595 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 604 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 		 610 aa  140  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  26.37 
 
 		 555 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 547 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 632 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.16 
 
 		 612 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  26.6 
 
 		 555 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 		 603 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 602 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 605 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  26.1 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 608 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 602 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 603 aa  136  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4650  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 534 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0127701  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 563 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 555 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 599 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 633 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.67 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 		 702 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 1538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 612 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 604 aa  135  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  23.46 
 
 		 610 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 612 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 567 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 554 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.27 
 
 		 598 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 551 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  26.55 
 
 		 618 aa  134  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 551 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 555 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.63 
 
 		 602 aa  133  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 		 622 aa  133  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  23.62 
 
 		 601 aa  133  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 601 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 1538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>