More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3087 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 505 aa  1039    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.775156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  58.57 
 
 		 504 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6317  AMP-dependent synthetase and ligase  55.13 
 
 		 509 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3272  AMP-dependent synthetase and ligase  56.92 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1087  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 473 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 601 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 599 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.7 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 594 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 546 aa  146  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 554 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 616 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 		 602 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.5 
 
 		 601 aa  143  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  29.72 
 
 		 553 aa  143  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 596 aa  143  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.64 
 
 		 610 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 595 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  24.24 
 
 		 603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 599 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 606 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 610 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  24.63 
 
 		 602 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 597 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 555 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 554 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 		 592 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  27.37 
 
 		 600 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 554 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 553 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.03 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.64 
 
 		 610 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  25.83 
 
 		 558 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 599 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  24.68 
 
 		 618 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 604 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  28.26 
 
 		 554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 604 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 632 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 		 604 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 610 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 546 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 604 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.23 
 
 		 610 aa  136  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 		 633 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  23.91 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  23.37 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 554 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  25.82 
 
 		 607 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 600 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4650  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0127701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 		 555 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 		 598 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.96 
 
 		 602 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 		 605 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  25.82 
 
 		 602 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 602 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 592 aa  133  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  23.55 
 
 		 609 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  24.68 
 
 		 591 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.24 
 
 		 599 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  25.97 
 
 		 547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.95 
 
 		 611 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  24.51 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02331  long-chain acyl-CoA synthetase  30.67 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  27.15 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.02 
 
 		 598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  25.09 
 
 		 611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 612 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  24.47 
 
 		 601 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 597 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 597 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  24.31 
 
 		 602 aa  129  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 597 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>