More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4650 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4650  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 534 aa  1062    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0127701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 504 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3736  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3272  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 504 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6317  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 509 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 505 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.775156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  22.9 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 612 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.44 
 
 		 937 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 560 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  28.6 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 633 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.64 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  28.21 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 604 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 555 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 594 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.76 
 
 		 563 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 555 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  23.5 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  23.5 
 
 		 555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 		 604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 599 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 632 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 602 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 599 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 599 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 1538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 1538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.05 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  25.54 
 
 		 605 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.16 
 
 		 602 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 		 635 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  22.31 
 
 		 559 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  28.98 
 
 		 1537 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 609 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  26.64 
 
 		 597 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 602 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.75 
 
 		 598 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 602 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 1557 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.76 
 
 		 563 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 563 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.46 
 
 		 563 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 607 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 		 604 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.81 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  26.23 
 
 		 605 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 601 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 554 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  24.81 
 
 		 554 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.84 
 
 		 610 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  24.05 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  24.18 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  22.78 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  22.78 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1087  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  24.81 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.64 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  24.52 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.82 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 602 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  28.11 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 596 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 649 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  22.78 
 
 		 588 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  24.77 
 
 		 679 aa  104  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  25.11 
 
 		 576 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 		 619 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 554 aa  104  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 		 622 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  24.46 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 609 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 600 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 887 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 615 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 598 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 596 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 551 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  24.28 
 
 		 599 aa  103  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 		 575 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 597 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.27 
 
 		 599 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 592 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  25.86 
 
 		 618 aa  103  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 615 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>