More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1626 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 519 aa  1046    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  22.58 
 
 		 599 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.65 
 
 		 563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3736  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.95 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6317  AMP-dependent synthetase and ligase  25.67 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1043  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 504 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.683174  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  22.8 
 
 		 600 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  22.56 
 
 		 601 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  24.41 
 
 		 600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.06 
 
 		 599 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  23.73 
 
 		 603 aa  127  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 		 505 aa  127  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.775156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  22.79 
 
 		 599 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  26.51 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4650  AMP-dependent synthetase and ligase  22.9 
 
 		 534 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0127701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 		 618 aa  123  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.58 
 
 		 602 aa  123  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  24.77 
 
 		 608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  21.72 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  22.14 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  22.14 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  22.14 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  22.03 
 
 		 616 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  23.74 
 
 		 602 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3272  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  22.62 
 
 		 619 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  21.44 
 
 		 599 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  23.11 
 
 		 605 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.81 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.94 
 
 		 563 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  23.43 
 
 		 599 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  20.93 
 
 		 632 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  23.88 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  21.54 
 
 		 596 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.56 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  22.15 
 
 		 600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 		 608 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  22.96 
 
 		 598 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  22.49 
 
 		 611 aa  113  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.11 
 
 		 610 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.95 
 
 		 599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  22.09 
 
 		 590 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  21.7 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  22.37 
 
 		 615 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  21.18 
 
 		 594 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  24.95 
 
 		 679 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  23.77 
 
 		 604 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1087  AMP-dependent synthetase and ligase  21.31 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  21.82 
 
 		 597 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.75 
 
 		 597 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 591 aa  110  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  22.03 
 
 		 811 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  22.66 
 
 		 633 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  23.74 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 592 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  23.61 
 
 		 600 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  21.6 
 
 		 607 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  21.83 
 
 		 602 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  22.73 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.83 
 
 		 607 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 606 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  23.35 
 
 		 593 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 607 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  21.18 
 
 		 602 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  22.8 
 
 		 599 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  23.01 
 
 		 602 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  23.85 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  23.64 
 
 		 580 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  22.68 
 
 		 606 aa  103  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  23.64 
 
 		 580 aa  103  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  20.62 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.19 
 
 		 606 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  21.7 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  22.27 
 
 		 615 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 812 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  22.94 
 
 		 604 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  21.56 
 
 		 605 aa  100  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  21.35 
 
 		 606 aa  100  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  21.52 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  22.58 
 
 		 609 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  20.6 
 
 		 616 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 		 606 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  21.54 
 
 		 612 aa  98.2  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 596 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18590  AMP-dependent synthetase and ligase family protein: long-chain fatty acid CoA ligase  20.67 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0471182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  20.99 
 
 		 610 aa  97.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  23.73 
 
 		 560 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  21.85 
 
 		 597 aa  97.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.32 
 
 		 612 aa  97.1  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  19.53 
 
 		 603 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  22.7 
 
 		 591 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  20.92 
 
 		 592 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  23.82 
 
 		 677 aa  95.1  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  20.94 
 
 		 602 aa  94.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  20.73 
 
 		 682 aa  94.4  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  21.1 
 
 		 585 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>