More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2794 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  67.05 
 
 		 510 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  87.04 
 
 		 517 aa  913    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  63.76 
 
 		 511 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  62.86 
 
 		 536 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  66.54 
 
 		 500 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  67.38 
 
 		 506 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 517 aa  1069    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  64.76 
 
 		 519 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  70.65 
 
 		 507 aa  762    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  62.19 
 
 		 539 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  66.67 
 
 		 506 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  64.82 
 
 		 519 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  62.43 
 
 		 547 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  64.65 
 
 		 530 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  56.56 
 
 		 526 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  59.42 
 
 		 508 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  57.34 
 
 		 504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  58.01 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  55.98 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  57.39 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  57.82 
 
 		 511 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  57.87 
 
 		 504 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  56.61 
 
 		 507 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  57.83 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  57.28 
 
 		 503 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  56.34 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  56.36 
 
 		 510 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  55.88 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  56.51 
 
 		 506 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  55.9 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  55.71 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  56.51 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  54.12 
 
 		 504 aa  528  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  54.17 
 
 		 504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  53.95 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  57.35 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  51.85 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  51.85 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  54.29 
 
 		 509 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  55.25 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  52.54 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  57.91 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  52.59 
 
 		 504 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  49.7 
 
 		 501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  51.01 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  41.97 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 502 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 507 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 553 aa  292  9e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 502 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 498 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 493 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.78 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 518 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 566 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 508 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.41 
 
 		 561 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.57 
 
 		 530 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.4 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.78 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.4 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 539 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 		 563 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 536 aa  256  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 		 513 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 		 563 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 		 582 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 		 563 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 		 563 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 495 aa  253  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 561 aa  253  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 508 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.14 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.48 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 511 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.65 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>