More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1014 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.09 
 
 		 566 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56 
 
 		 573 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  56.55 
 
 		 567 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.91 
 
 		 557 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.91 
 
 		 563 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.53 
 
 		 555 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2263  AMP-dependent synthetase and ligase  64.85 
 
 		 558 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.694237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.09 
 
 		 557 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.46 
 
 		 572 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.91 
 
 		 572 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  55.64 
 
 		 569 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.73 
 
 		 563 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.82 
 
 		 557 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.09 
 
 		 557 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.19 
 
 		 557 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.55 
 
 		 572 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.18 
 
 		 557 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.45 
 
 		 562 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.27 
 
 		 557 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.45 
 
 		 562 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 553 aa  1147    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.176827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.45 
 
 		 577 aa  662    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.91 
 
 		 557 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.73 
 
 		 558 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.91 
 
 		 557 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.91 
 
 		 557 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1606  AMP-dependent synthetase and ligase  64.66 
 
 		 558 aa  754    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.016837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56 
 
 		 557 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.73 
 
 		 557 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.73 
 
 		 561 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.82 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  53.55 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  53.55 
 
 		 583 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.18 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.55 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.73 
 
 		 561 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.73 
 
 		 561 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.73 
 
 		 561 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.55 
 
 		 583 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.55 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  53.55 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.55 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.73 
 
 		 561 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.55 
 
 		 561 aa  631  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.55 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.36 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  51.45 
 
 		 552 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  51.17 
 
 		 584 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  51.17 
 
 		 584 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  50.99 
 
 		 584 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  50.89 
 
 		 584 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  50.71 
 
 		 584 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  50.63 
 
 		 586 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  49.82 
 
 		 553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  50.45 
 
 		 584 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  50.36 
 
 		 550 aa  581  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1189  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.44 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2409  AMP-dependent synthetase and ligase  49.64 
 
 		 554 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0704611  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  49.27 
 
 		 553 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 		 601 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  49.2 
 
 		 604 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.72 
 
 		 560 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 559 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  49.18 
 
 		 560 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.64 
 
 		 562 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  46.82 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  47.58 
 
 		 599 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.55 
 
 		 581 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1764  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1782  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1803  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1276  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.011036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  46.64 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1957  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000391168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  49.55 
 
 		 558 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 566 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1035  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.526739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0305097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.74 
 
 		 562 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.75 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.75 
 
 		 581 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 		 569 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 562 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  48.83 
 
 		 559 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  49.01 
 
 		 559 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.64 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.64 
 
 		 562 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.65 
 
 		 566 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.92 
 
 		 566 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 		 579 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2529  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.99 
 
 		 590 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 557 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 557 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  49.46 
 
 		 566 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.64 
 
 		 562 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 557 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 557 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.73 
 
 		 569 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>