193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1053 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
228 aa  456  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
229 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.55 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.55 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  26.73 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  25.5 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.74 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.74 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.45 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.77 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.77 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  28.24 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  25.27 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  23.47 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.76 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.4 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  27.32 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.4 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  25.5 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.14 
 
 
348 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.01 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  23.2 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.98 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2611  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.78 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  23.71 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.83 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.89 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.79 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3341  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.66 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.02 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  21.72 
 
 
355 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  24.21 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.69 
 
 
350 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.86 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.91 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  24.55 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.2 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2689  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.1 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  23.21 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.64 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.71 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  22.53 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.61 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.21 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  22.05 
 
 
352 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.99 
 
 
231 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
225 aa  52  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  22.75 
 
 
215 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 
239 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 
229 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.83 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.67 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.47 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.86 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  20 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3340  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.89 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  23.76 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  25.83 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0829617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>