216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0213 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
224 aa  463  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  49.77 
 
 
224 aa  231  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  46.08 
 
 
238 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  46.12 
 
 
219 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  39.01 
 
 
227 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  36.24 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  38.57 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  42.58 
 
 
215 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  40.49 
 
 
219 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.18 
 
 
240 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.85 
 
 
222 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 
235 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  33.18 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 
225 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
218 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  31.22 
 
 
227 aa  101  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  30.73 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.1 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  24.52 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13660  cAMP-binding protein  26.53 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.52 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  26.34 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  25.99 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  23.5 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.77 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.41 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.37 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.27 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  25.31 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.33 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  21.32 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.99 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
238 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.89 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.28 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.81 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.22 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.42 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  23.7 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  26.79 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 
246 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
222 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.77 
 
 
227 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 
229 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  21.15 
 
 
230 aa  52  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  20.67 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  26.7 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>