More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1580 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
215 aa  430  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 
229 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
227 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  34.91 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.27 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.14 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  27.62 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  24.66 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  33.15 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.36 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  25.73 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.79 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  28.08 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  26.94 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  25.82 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.72 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  23.98 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.15 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  25.35 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.56 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  26.89 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.69 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  23.53 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.69 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  23.53 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  26.5 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  25 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  26.15 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.23 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  26.5 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  26.11 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.58 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
403 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  26.5 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  26.5 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
267 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  27.91 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  27 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  28.43 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  26.5 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  23.39 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  21.6 
 
 
251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  22.73 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  26.5 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  25.12 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>