74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03090 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.7 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  31.66 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.68 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  30.52 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  31.71 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  30.92 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  23.83 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.02 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.03 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13660  cAMP-binding protein  26.24 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.99 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2611  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  24.21 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.9 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.79 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.76 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6078  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4595  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596625  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4828  cyclic nucleotide-binding protein  22.86 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0724019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3331  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2229  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5024  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2769  cyclic nucleotide-binding  30.77 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.311339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.3 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.02 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 254 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 223 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.67 
 
 		 254 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 231 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0984  Crp-like transcriptional regulator  21.76 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>