90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2221 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  40.32 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  34.68 
 
 		 222 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.18 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  35.24 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  34.4 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  34.58 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.5 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.53 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  23.03 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  22.51 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13660  cAMP-binding protein  24.87 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  22.22 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.81 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.02 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.3 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.54 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.75 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  23.96 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.32 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.7 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.17 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.95 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.95 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.63 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.46 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.49 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.82 
 
 		 573 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.29 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.44 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.79 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  19.71 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2609  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.35 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.35 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.35 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.35 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  20.35 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.91 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.35 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0984  Crp-like transcriptional regulator  24.1 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4265  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.53 
 
 		 567 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.99 
 
 		 352 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 575 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7766  nitrogen fixation regulation protein fixK  34.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.03 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 231 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 257 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 227 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>