249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6129 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  74.26 
 
 
293 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.1 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.73 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4238  transcriptional activator FtrB  39.06 
 
 
234 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  37.55 
 
 
232 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  31 
 
 
239 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3861  transcriptional activator FtrB  38.02 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0301  transcriptional activator FtrB  31.63 
 
 
236 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0277  transcriptional activator FtrB  31.63 
 
 
236 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  29.44 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 
227 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.12 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.12 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.75 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  30.43 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.11 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  29.95 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  25.14 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  28.22 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  26.11 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.71 
 
 
229 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
227 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.84 
 
 
227 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.49 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  28.37 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  28.37 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  28.37 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2635  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.545323  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.58 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
224 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  26.63 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.23 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.4 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.63 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  27.75 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
222 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0642  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 
223 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  28.57 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  28.26 
 
 
227 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  26.97 
 
 
228 aa  55.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  30.29 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  23.72 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>