102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1511 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.44 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 251 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3861  transcriptional activator FtrB  33.91 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  35.24 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4238  transcriptional activator FtrB  35.87 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0301  transcriptional activator FtrB  27.63 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0277  transcriptional activator FtrB  27.63 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  26.75 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  24.57 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2635  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.545323  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  26.67 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.86 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.86 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  34.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3081  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0390484  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  24.49 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.66 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3585  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.921585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.08 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  30.14 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5024  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.14 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  24.68 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2689  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  23.2 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  24.83 
 
 		 563 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.19 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3129  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.22 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  28.87 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  23.64 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  23.64 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1428  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.97 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  23.64 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  23.64 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.84 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.4 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0642  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  40.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>