More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1929 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  99.15 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.61 
 
 		 235 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.17 
 
 		 235 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  95.26 
 
 		 235 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  88.41 
 
 		 235 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  72.81 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  72.81 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  72.81 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  72.81 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  72.81 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  73.09 
 
 		 266 aa  328  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.58 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  57.92 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  57.01 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.9 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  52.05 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.36 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.36 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 278 aa  198  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0243  cyclic nucleotide-binding  40.27 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0313  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  32.88 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  34.09 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.59 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.68 
 
 		 239 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3129  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.18 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  32.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4858  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.748285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3781  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  33.81 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.68 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  34 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.44 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.91 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.26 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0827  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0664388  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.46 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.51 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.92 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.58 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.63 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.32 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.05 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.94 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.19 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.38 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  30.65 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3110  cyclic nucleotide-binding protein  29.3 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  30.65 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>