249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0301 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0301  transcriptional activator FtrB  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0277  transcriptional activator FtrB  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  81.36 
 
 
239 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3861  transcriptional activator FtrB  43.97 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  40.79 
 
 
232 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4238  transcriptional activator FtrB  40.35 
 
 
234 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.05 
 
 
293 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  31.9 
 
 
241 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
240 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
241 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
251 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.1 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  28.77 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  30.05 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4954  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00163752  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.09 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.46 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  28.51 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5024  cyclic nucleotide-binding protein  28.65 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923745  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  29 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.46 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.46 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3081  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0390484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  25.49 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  24.41 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.84 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.93 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.93 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  22.93 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  22.93 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.28 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.28 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2635  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.545323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  23.28 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.75 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1622  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.93 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.85 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.11 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  23.64 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.92 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.97 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
241 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.27 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.02 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  28.27 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  26.9 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  22.27 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  23.81 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2638  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.08 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.73 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4212  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.98 
 
 
303 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.33 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
226 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  27.72 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  24.37 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>