215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3861 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3861  transcriptional activator FtrB  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4238  transcriptional activator FtrB  50 
 
 
234 aa  221  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  43.67 
 
 
232 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0301  transcriptional activator FtrB  43.97 
 
 
236 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0277  transcriptional activator FtrB  43.97 
 
 
236 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  41.38 
 
 
239 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.24 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
251 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 
269 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  23.85 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  28.36 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.17 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.48 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.64 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.3 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.34 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.34 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5024  cyclic nucleotide-binding protein  40.24 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923745  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  22.67 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4954  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00163752  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  27.91 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.71 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.24 
 
 
229 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.24 
 
 
229 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  25.24 
 
 
229 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2635  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.545323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.24 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.24 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  25.24 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.27 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  25.24 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
230 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
228 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  31.02 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.55 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  24.44 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
231 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  24.77 
 
 
230 aa  58.9  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  30.26 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
224 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.71 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.66 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  24.39 
 
 
221 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
220 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.72 
 
 
232 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.72 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.59 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.79 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  39.74 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  22.71 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  26.67 
 
 
229 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  23.12 
 
 
227 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  21 
 
 
213 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  24.6 
 
 
214 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  22.71 
 
 
227 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.47 
 
 
225 aa  52  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.78 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.09 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.72 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.9 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>