56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3951 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  30.14 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.09 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  24.04 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  24.52 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.62 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  24.37 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.59 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.38 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  22.02 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  23.3 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.02 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.53 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0335  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.51 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.68 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.57 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  25.37 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.5 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2611  cyclic nucleotide-binding protein  27.2 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  23.79 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.79 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.81 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.35 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.99 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  19.81 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.47 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  18.45 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.63 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.32 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  20.81 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  19.51 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4243  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.04 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  18.38 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  18.13 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>