More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4550 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0335  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  73.55 
 
 
175 aa  235  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.26 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.5 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4053  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.6 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.46 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
235 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.35 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.32 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.87 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.75 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.57 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.82 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.84 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  27.41 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  26.9 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  26.9 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.5 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  26.9 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.62 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  23.83 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.13 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  25.89 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.58 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  23.19 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.22 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  25.71 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  23.21 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.7 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>