137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09591 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0643  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  43.62 
 
 
1097 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1411  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  56.67 
 
 
1077 aa  1137    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.577344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1653  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  56.54 
 
 
1081 aa  1086    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.339472  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14751  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  43.43 
 
 
1097 aa  1031    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.683363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09591  exodeoxyribonuclease V gamma chain  100 
 
 
1103 aa  2197    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.507283 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10811  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  49.1 
 
 
1105 aa  1132    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.240018 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1116  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.69 
 
 
1060 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0230584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12111  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  24.24 
 
 
1060 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12121  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  24.11 
 
 
1060 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11961  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  22.55 
 
 
1060 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.19 
 
 
1060 aa  302  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  26.66 
 
 
1127 aa  290  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.82 
 
 
1054 aa  288  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.14 
 
 
1113 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.61 
 
 
1091 aa  284  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.97 
 
 
1077 aa  278  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.23 
 
 
1068 aa  275  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.45 
 
 
1077 aa  270  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.66 
 
 
1143 aa  266  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  25.54 
 
 
1148 aa  265  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28 
 
 
1103 aa  264  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  25.5 
 
 
1075 aa  253  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.33 
 
 
1141 aa  253  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  25.13 
 
 
1164 aa  251  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.21 
 
 
1173 aa  249  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.93 
 
 
1085 aa  248  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.22 
 
 
1084 aa  247  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.03 
 
 
1061 aa  245  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  24.58 
 
 
1163 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.4 
 
 
1198 aa  241  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.61 
 
 
1168 aa  239  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25 
 
 
1074 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.83 
 
 
1082 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.83 
 
 
1082 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.96 
 
 
1080 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.28 
 
 
1158 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.91 
 
 
1206 aa  235  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.14 
 
 
1158 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.69 
 
 
1184 aa  234  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.37 
 
 
1159 aa  234  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.69 
 
 
1163 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.36 
 
 
1131 aa  233  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  26.28 
 
 
1132 aa  233  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.96 
 
 
1064 aa  233  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.83 
 
 
1071 aa  232  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.3 
 
 
1160 aa  230  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  24.42 
 
 
1127 aa  229  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.28 
 
 
1160 aa  229  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.57 
 
 
1083 aa  228  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  25.63 
 
 
1123 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  27.01 
 
 
1097 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.73 
 
 
1183 aa  228  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  25.54 
 
 
1123 aa  226  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.72 
 
 
1151 aa  225  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  25.45 
 
 
1123 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.44 
 
 
1190 aa  225  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.98 
 
 
1149 aa  225  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  25.92 
 
 
1122 aa  225  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  25.83 
 
 
1122 aa  224  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  25.2 
 
 
1123 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  25.83 
 
 
1122 aa  224  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.17 
 
 
1164 aa  224  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  25.37 
 
 
1123 aa  224  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.63 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  25.63 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  25.63 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  25.74 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  25.48 
 
 
1132 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.68 
 
 
1166 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  24.76 
 
 
1123 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  25.63 
 
 
1122 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  25.99 
 
 
1123 aa  223  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.64 
 
 
1187 aa  221  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  29.03 
 
 
1171 aa  220  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  25.74 
 
 
1122 aa  220  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  24.68 
 
 
1123 aa  219  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  24.68 
 
 
1123 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  25.59 
 
 
1157 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.89 
 
 
1192 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.09 
 
 
1150 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.25 
 
 
1158 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.3 
 
 
1197 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  24.48 
 
 
1124 aa  215  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.2 
 
 
1270 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28 
 
 
1226 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  27.99 
 
 
1260 aa  212  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.99 
 
 
1260 aa  212  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.28 
 
 
1270 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  28.25 
 
 
1156 aa  210  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.36 
 
 
1270 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.85 
 
 
1274 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2428  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.06 
 
 
1128 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550911  hitchhiker  0.0018506 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.17 
 
 
1098 aa  208  5e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.98 
 
 
1269 aa  207  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.32 
 
 
1236 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.25 
 
 
1375 aa  205  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.8 
 
 
1234 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.11 
 
 
1234 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.19 
 
 
1158 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.09 
 
 
1270 aa  198  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>