139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2095 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  72.8 
 
 
1270 aa  1816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  56.41 
 
 
1375 aa  1447    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  36.04 
 
 
1166 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  75.81 
 
 
1236 aa  1852    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  75.67 
 
 
1234 aa  1842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  60.48 
 
 
1270 aa  1503    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  75.24 
 
 
1234 aa  1843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  48.56 
 
 
1163 aa  1102    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  36.13 
 
 
1149 aa  681    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  94.67 
 
 
1260 aa  2457    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  94.67 
 
 
1260 aa  2457    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  35.69 
 
 
1163 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  58.69 
 
 
1192 aa  1394    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  79.69 
 
 
1226 aa  2037    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  37.35 
 
 
1148 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  96.31 
 
 
1274 aa  2516    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  99.06 
 
 
1270 aa  2584    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  35.53 
 
 
1164 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  61.65 
 
 
1187 aa  1486    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  34.93 
 
 
1123 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  59.97 
 
 
1269 aa  1452    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  34.99 
 
 
1127 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1270 aa  2611    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  62.45 
 
 
1190 aa  1495    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  35.1 
 
 
1131 aa  625  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  34.16 
 
 
1124 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  34.42 
 
 
1123 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  34.5 
 
 
1123 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  33.36 
 
 
1122 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.36 
 
 
1122 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  33.36 
 
 
1122 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  33.36 
 
 
1122 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  34.34 
 
 
1123 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  33.36 
 
 
1122 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  33.36 
 
 
1122 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  33.28 
 
 
1122 aa  606  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  33.36 
 
 
1122 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  33.71 
 
 
1123 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  33.74 
 
 
1123 aa  599  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  33.79 
 
 
1123 aa  599  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  33.79 
 
 
1123 aa  599  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  33.12 
 
 
1122 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  33.79 
 
 
1123 aa  599  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  33.78 
 
 
1132 aa  592  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  33.63 
 
 
1132 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  34.01 
 
 
1128 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.41 
 
 
1077 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.06 
 
 
1091 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.25 
 
 
1077 aa  561  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  33.09 
 
 
1060 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.44 
 
 
1054 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.11 
 
 
1068 aa  539  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  31.1 
 
 
1127 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.51 
 
 
1061 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.05 
 
 
1158 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.45 
 
 
1160 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.15 
 
 
1074 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.49 
 
 
1071 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  32.71 
 
 
1171 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.57 
 
 
1158 aa  515  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.89 
 
 
1159 aa  513  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.37 
 
 
1160 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.9 
 
 
1158 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  32.65 
 
 
1157 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  31.05 
 
 
1075 aa  505  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.7 
 
 
1150 aa  493  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  32.59 
 
 
1156 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.15 
 
 
1144 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.52 
 
 
1085 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.1 
 
 
1198 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  34.45 
 
 
1173 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.87 
 
 
1164 aa  479  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.85 
 
 
1168 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.97 
 
 
1184 aa  469  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.89 
 
 
1197 aa  469  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.58 
 
 
1183 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.31 
 
 
1162 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.55 
 
 
1206 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.65 
 
 
1064 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1168  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.16 
 
 
1210 aa  439  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.32 
 
 
1098 aa  419  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0520  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.36 
 
 
1174 aa  419  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.318804  normal  0.0360548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4569  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.15 
 
 
1169 aa  406  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.76 
 
 
1294 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.5 
 
 
1138 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1849  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.42 
 
 
1218 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.013439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2931  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.29 
 
 
1130 aa  365  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2546  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.29 
 
 
1130 aa  365  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4322  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.75 
 
 
1112 aa  344  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05437  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.71 
 
 
1137 aa  336  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1613  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.07 
 
 
1124 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1187  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.29 
 
 
1112 aa  327  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.720814  normal  0.579184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0734  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.47 
 
 
1112 aa  324  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1214  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.47 
 
 
1112 aa  324  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1749  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.28 
 
 
1121 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246728  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2839  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.06 
 
 
1133 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601793  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1815  exodeoxyribonuclease V gamma chain  26.84 
 
 
1121 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.19 
 
 
1063 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0681  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.03 
 
 
1114 aa  302  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0471  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.03 
 
 
1114 aa  302  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0516412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>