133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1116 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1116  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1060 aa  2071    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0230584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12111  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  85.94 
 
 
1060 aa  1775    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11961  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  68.84 
 
 
1060 aa  1458    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12121  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  85.75 
 
 
1060 aa  1779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10811  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  28.08 
 
 
1105 aa  436  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.240018 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0643  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26 
 
 
1097 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14751  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  26 
 
 
1097 aa  383  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.683363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09591  exodeoxyribonuclease V gamma chain  23.38 
 
 
1103 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.507283 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1411  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  21.97 
 
 
1077 aa  343  7e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.577344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1653  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.27 
 
 
1081 aa  336  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.339472  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.56 
 
 
1091 aa  171  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  19.76 
 
 
1075 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  18.65 
 
 
1127 aa  161  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  18.56 
 
 
1060 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  18.44 
 
 
1085 aa  159  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.73 
 
 
1068 aa  153  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.42 
 
 
1077 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.4 
 
 
1064 aa  152  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.31 
 
 
1061 aa  151  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21 
 
 
1077 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  18.21 
 
 
1141 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.71 
 
 
1274 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.94 
 
 
1131 aa  137  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.54 
 
 
1190 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.62 
 
 
1113 aa  135  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.58 
 
 
1270 aa  135  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.35 
 
 
1187 aa  135  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.95 
 
 
1163 aa  134  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  21.29 
 
 
1260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.29 
 
 
1260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.56 
 
 
1054 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.58 
 
 
1270 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.01 
 
 
1234 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.9 
 
 
1226 aa  128  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  20.48 
 
 
1148 aa  128  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.92 
 
 
1074 aa  128  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.15 
 
 
1234 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.16 
 
 
1071 aa  127  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.84 
 
 
1375 aa  127  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.07 
 
 
1236 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.17 
 
 
1080 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.33 
 
 
1183 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  16.57 
 
 
1084 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  20.74 
 
 
1163 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.89 
 
 
1192 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.46 
 
 
1184 aa  119  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.31 
 
 
1164 aa  119  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2428  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.06 
 
 
1128 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550911  hitchhiker  0.0018506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.29 
 
 
1198 aa  118  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  20.38 
 
 
1123 aa  117  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.25 
 
 
1103 aa  117  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.79 
 
 
1270 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.48 
 
 
1158 aa  116  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  17.5 
 
 
1097 aa  115  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.38 
 
 
1082 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  17.38 
 
 
1082 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.76 
 
 
1098 aa  114  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  20.2 
 
 
1164 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.71 
 
 
1160 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  20.74 
 
 
1122 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  20.75 
 
 
1127 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  20.74 
 
 
1122 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  20.61 
 
 
1122 aa  112  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.71 
 
 
1160 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.62 
 
 
1158 aa  111  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.06 
 
 
1158 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  20.26 
 
 
1122 aa  111  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.49 
 
 
1122 aa  110  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  18.79 
 
 
1171 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.73 
 
 
1197 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  20.49 
 
 
1122 aa  110  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  20.49 
 
 
1122 aa  110  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.34 
 
 
1159 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  20.49 
 
 
1122 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  20.33 
 
 
1124 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  20.57 
 
 
1123 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4322  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  18.08 
 
 
1112 aa  108  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  18.51 
 
 
1156 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  20.64 
 
 
1123 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  20.88 
 
 
1122 aa  107  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.84 
 
 
1162 aa  106  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  20.54 
 
 
1123 aa  105  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  16.54 
 
 
1151 aa  105  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  19.16 
 
 
1128 aa  104  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  18.8 
 
 
1123 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  18.8 
 
 
1123 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  18.8 
 
 
1123 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  18.8 
 
 
1123 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  18.8 
 
 
1123 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  18.51 
 
 
1173 aa  102  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  15.59 
 
 
1083 aa  101  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.28 
 
 
1166 aa  101  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.22 
 
 
1158 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  19.12 
 
 
1157 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1168  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  19.18 
 
 
1210 aa  99.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.35 
 
 
1144 aa  99.4  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  18.38 
 
 
1138 aa  98.6  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.01 
 
 
1270 aa  98.6  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1187  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  18.01 
 
 
1112 aa  98.2  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.720814  normal  0.579184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0734  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  18.01 
 
 
1112 aa  97.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>