137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0643 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0643  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1097 aa  2223    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1411  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  39.35 
 
 
1077 aa  865    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.577344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1653  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  39.39 
 
 
1081 aa  840    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.339472  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14751  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  97.54 
 
 
1097 aa  2146    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.683363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09591  exodeoxyribonuclease V gamma chain  43.62 
 
 
1103 aa  993    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.507283 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10811  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  42.27 
 
 
1105 aa  951    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.240018 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12111  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  26.99 
 
 
1060 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1116  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26 
 
 
1060 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0230584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11961  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  27.26 
 
 
1060 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12121  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  27.15 
 
 
1060 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.23 
 
 
1091 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25 
 
 
1068 aa  289  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  23.87 
 
 
1060 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.7 
 
 
1054 aa  273  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.37 
 
 
1077 aa  265  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.37 
 
 
1061 aa  262  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.24 
 
 
1077 aa  262  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  23.37 
 
 
1127 aa  261  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.31 
 
 
1074 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.41 
 
 
1071 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.01 
 
 
1141 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  22.64 
 
 
1148 aa  237  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.32 
 
 
1113 aa  231  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.92 
 
 
1192 aa  231  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  21 
 
 
1075 aa  226  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.07 
 
 
1064 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.67 
 
 
1206 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.28 
 
 
1163 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.77 
 
 
1084 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  21.47 
 
 
1097 aa  222  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  24.32 
 
 
1123 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  21.38 
 
 
1164 aa  221  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  23.44 
 
 
1123 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.66 
 
 
1226 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.62 
 
 
1198 aa  220  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  23.59 
 
 
1123 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  23.41 
 
 
1123 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  23.59 
 
 
1123 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  24.32 
 
 
1123 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  23.59 
 
 
1123 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  24.32 
 
 
1123 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.98 
 
 
1149 aa  218  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.32 
 
 
1173 aa  218  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  22.02 
 
 
1163 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.58 
 
 
1080 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  23.33 
 
 
1127 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.26 
 
 
1158 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.15 
 
 
1131 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.79 
 
 
1187 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.3 
 
 
1190 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25 
 
 
1159 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.26 
 
 
1158 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  25.78 
 
 
1260 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.78 
 
 
1260 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.53 
 
 
1083 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.18 
 
 
1160 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  24.23 
 
 
1132 aa  213  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.04 
 
 
1160 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  22.42 
 
 
1124 aa  213  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  25.26 
 
 
1132 aa  212  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.29 
 
 
1158 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.92 
 
 
1164 aa  210  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.09 
 
 
1274 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.22 
 
 
1085 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.09 
 
 
1270 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.09 
 
 
1270 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.94 
 
 
1082 aa  208  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  20.94 
 
 
1082 aa  208  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.34 
 
 
1183 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.98 
 
 
1143 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  22.86 
 
 
1122 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.78 
 
 
1150 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  22.86 
 
 
1122 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  22.86 
 
 
1122 aa  206  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.14 
 
 
1197 aa  205  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.77 
 
 
1122 aa  205  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  22.77 
 
 
1122 aa  205  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  22.77 
 
 
1122 aa  205  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  22.77 
 
 
1122 aa  205  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  22.86 
 
 
1122 aa  205  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.68 
 
 
1166 aa  205  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.58 
 
 
1234 aa  205  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.58 
 
 
1234 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  24.71 
 
 
1156 aa  204  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  23.15 
 
 
1157 aa  204  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.22 
 
 
1270 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.46 
 
 
1236 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.09 
 
 
1270 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  23.61 
 
 
1171 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  22.51 
 
 
1128 aa  201  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  22.65 
 
 
1122 aa  201  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  24.18 
 
 
1123 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.82 
 
 
1168 aa  197  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.3 
 
 
1269 aa  193  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.76 
 
 
1151 aa  192  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.5 
 
 
1375 aa  190  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.06 
 
 
1144 aa  189  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.1 
 
 
1184 aa  187  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2546  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.32 
 
 
1130 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2931  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.32 
 
 
1130 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>