137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1411 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0643  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  39.35 
 
 
1097 aa  866    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1411  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  100 
 
 
1077 aa  2123    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.577344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1653  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  70.33 
 
 
1081 aa  1402    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.339472  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14751  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  39.44 
 
 
1097 aa  869    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.683363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09591  exodeoxyribonuclease V gamma chain  56.67 
 
 
1103 aa  1101    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.507283 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10811  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  43.69 
 
 
1105 aa  935    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.240018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.62 
 
 
1060 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11961  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  21.52 
 
 
1060 aa  348  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12111  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  22.36 
 
 
1060 aa  347  5e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12121  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  22.38 
 
 
1060 aa  347  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1116  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.97 
 
 
1060 aa  346  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0230584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.68 
 
 
1127 aa  332  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.85 
 
 
1077 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.91 
 
 
1077 aa  327  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.16 
 
 
1091 aa  322  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.7 
 
 
1068 aa  321  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.38 
 
 
1054 aa  318  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  28.54 
 
 
1075 aa  313  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.05 
 
 
1061 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.99 
 
 
1085 aa  294  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  27.9 
 
 
1148 aa  288  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.93 
 
 
1074 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.56 
 
 
1141 aa  285  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  27.61 
 
 
1164 aa  283  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.25 
 
 
1173 aa  281  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.49 
 
 
1071 aa  277  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  26.76 
 
 
1163 aa  275  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  26.5 
 
 
1127 aa  270  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.92 
 
 
1080 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.45 
 
 
1184 aa  261  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.39 
 
 
1149 aa  260  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.56 
 
 
1082 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.56 
 
 
1082 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  27.12 
 
 
1123 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  27.12 
 
 
1123 aa  259  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  26.96 
 
 
1123 aa  258  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.11 
 
 
1226 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.68 
 
 
1113 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.25 
 
 
1064 aa  255  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.59 
 
 
1190 aa  253  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.51 
 
 
1083 aa  252  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.5 
 
 
1158 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  26.59 
 
 
1132 aa  252  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.47 
 
 
1163 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  26.63 
 
 
1132 aa  251  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.49 
 
 
1158 aa  250  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.55 
 
 
1164 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.12 
 
 
1197 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.87 
 
 
1159 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  27.8 
 
 
1123 aa  245  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.79 
 
 
1084 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.26 
 
 
1234 aa  244  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.45 
 
 
1143 aa  244  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.71 
 
 
1234 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.46 
 
 
1274 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.34 
 
 
1270 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.17 
 
 
1236 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.9 
 
 
1187 aa  241  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.68 
 
 
1160 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.68 
 
 
1160 aa  240  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.42 
 
 
1270 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  26.85 
 
 
1171 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  28.71 
 
 
1260 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.71 
 
 
1260 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.53 
 
 
1150 aa  238  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.82 
 
 
1131 aa  238  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  26.17 
 
 
1157 aa  237  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.1 
 
 
1144 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.61 
 
 
1166 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  27.11 
 
 
1123 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.68 
 
 
1270 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.62 
 
 
1103 aa  233  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  26.72 
 
 
1123 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  26.92 
 
 
1123 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  26.75 
 
 
1123 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.99 
 
 
1168 aa  231  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  29.22 
 
 
1156 aa  231  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  26.46 
 
 
1123 aa  231  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.41 
 
 
1192 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  26.73 
 
 
1124 aa  228  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.05 
 
 
1183 aa  227  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.73 
 
 
1098 aa  227  1e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.45 
 
 
1206 aa  227  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.74 
 
 
1198 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.55 
 
 
1158 aa  224  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.08 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  26.08 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  26.08 
 
 
1122 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  26.25 
 
 
1122 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  26.05 
 
 
1122 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  26.58 
 
 
1097 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  25.96 
 
 
1122 aa  221  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  25.7 
 
 
1122 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  25.7 
 
 
1122 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  25.99 
 
 
1122 aa  217  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.2 
 
 
1269 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1168  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.74 
 
 
1210 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.33 
 
 
1270 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  26.71 
 
 
1128 aa  213  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.83 
 
 
1375 aa  213  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>