138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0901 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2428  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.08 
 
 		 1128 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550911  hitchhiker  0.0018506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.37 
 
 		 1143 aa  699    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 		 1082 aa  2151    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  52.46 
 
 		 1113 aa  984    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 		 1082 aa  2151    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  76.18 
 
 		 1084 aa  1607    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  40.98 
 
 		 1103 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  97.96 
 
 		 1080 aa  2072    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  74.26 
 
 		 1083 aa  1579    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  67 
 
 		 1097 aa  1355    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  40.29 
 
 		 1158 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  41.99 
 
 		 1151 aa  673    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  49.36 
 
 		 1141 aa  902    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.25 
 
 		 1091 aa  439  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.84 
 
 		 1068 aa  436  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.95 
 
 		 1075 aa  405  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.64 
 
 		 1074 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.97 
 
 		 1061 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.61 
 
 		 1060 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.47 
 
 		 1071 aa  396  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.79 
 
 		 1054 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.14 
 
 		 1077 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.6 
 
 		 1077 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.88 
 
 		 1127 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  28.61 
 
 		 1123 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  28.7 
 
 		 1132 aa  344  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  27.45 
 
 		 1123 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  27.82 
 
 		 1123 aa  335  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  27.26 
 
 		 1123 aa  334  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  27.26 
 
 		 1123 aa  334  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  27.82 
 
 		 1123 aa  333  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.36 
 
 		 1131 aa  333  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  27.82 
 
 		 1123 aa  333  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  27.15 
 
 		 1123 aa  333  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  27.17 
 
 		 1123 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.63 
 
 		 1149 aa  331  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  27.36 
 
 		 1148 aa  330  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.25 
 
 		 1085 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  27.31 
 
 		 1122 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  27.22 
 
 		 1122 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  27.22 
 
 		 1122 aa  324  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1122 aa  324  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  27.85 
 
 		 1128 aa  325  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.22 
 
 		 1122 aa  324  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  27.03 
 
 		 1164 aa  324  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  27.22 
 
 		 1122 aa  324  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  27.22 
 
 		 1122 aa  324  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  28.32 
 
 		 1132 aa  323  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.43 
 
 		 1166 aa  321  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  26.96 
 
 		 1122 aa  320  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  27.05 
 
 		 1122 aa  318  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  27.22 
 
 		 1124 aa  311  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.56 
 
 		 1187 aa  311  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  26.28 
 
 		 1127 aa  311  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  26.52 
 
 		 1163 aa  310  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.29 
 
 		 1163 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.66 
 
 		 1064 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.01 
 
 		 1173 aa  297  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.98 
 
 		 1098 aa  295  3e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.26 
 
 		 1144 aa  294  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.56 
 
 		 1164 aa  290  8e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.64 
 
 		 1162 aa  289  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.25 
 
 		 1198 aa  287  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.64 
 
 		 1158 aa  287  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  28.51 
 
 		 1171 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.53 
 
 		 1184 aa  283  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.54 
 
 		 1160 aa  283  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.74 
 
 		 1190 aa  283  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.9 
 
 		 1206 aa  277  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.04 
 
 		 1150 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.98 
 
 		 1226 aa  275  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.59 
 
 		 1160 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.13 
 
 		 1192 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.64 
 
 		 1159 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.24 
 
 		 1197 aa  272  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.05 
 
 		 1158 aa  270  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  27.72 
 
 		 1156 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.43 
 
 		 1270 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.39 
 
 		 1158 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.57 
 
 		 1063 aa  268  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.29 
 
 		 1270 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  26.7 
 
 		 1157 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1260 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.31 
 
 		 1260 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.88 
 
 		 1269 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1411  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  26.56 
 
 		 1077 aa  257  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.577344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.46 
 
 		 1375 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.93 
 
 		 1270 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.77 
 
 		 1270 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.65 
 
 		 1168 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.86 
 
 		 1274 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.34 
 
 		 1138 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.06 
 
 		 1236 aa  253  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.58 
 
 		 1234 aa  253  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.92 
 
 		 1234 aa  251  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1389  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.95 
 
 		 1197 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1769.1  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.75 
 
 		 1114 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28 
 
 		 1183 aa  244  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0681  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.75 
 
 		 1114 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0471  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.75 
 
 		 1114 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0516412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>