138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3372 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.38 
 
 
1103 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  45.99 
 
 
1141 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.7 
 
 
1082 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1143 aa  2190    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  40.46 
 
 
1151 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  45.23 
 
 
1113 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.7 
 
 
1082 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.45 
 
 
1084 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.88 
 
 
1080 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  43.27 
 
 
1083 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  44.04 
 
 
1097 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.35 
 
 
1158 aa  663    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2428  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  46.1 
 
 
1128 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550911  hitchhiker  0.0018506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.49 
 
 
1091 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.34 
 
 
1068 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.66 
 
 
1074 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.26 
 
 
1071 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.67 
 
 
1054 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.51 
 
 
1061 aa  429  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  31.22 
 
 
1127 aa  415  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.95 
 
 
1075 aa  412  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  31.11 
 
 
1060 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.28 
 
 
1077 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.62 
 
 
1077 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.81 
 
 
1085 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  30.89 
 
 
1123 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  30.79 
 
 
1123 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  30.76 
 
 
1123 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  28.77 
 
 
1123 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  28.77 
 
 
1123 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.58 
 
 
1149 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  28.74 
 
 
1123 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  28.77 
 
 
1123 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  29.75 
 
 
1123 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  30.91 
 
 
1128 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  28.86 
 
 
1123 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  26.96 
 
 
1164 aa  366  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  28.46 
 
 
1124 aa  360  8e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.52 
 
 
1131 aa  360  9e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  29.52 
 
 
1122 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  29.52 
 
 
1122 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.52 
 
 
1122 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  29.22 
 
 
1122 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  29.52 
 
 
1122 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  29.52 
 
 
1122 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  29.52 
 
 
1122 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.97 
 
 
1064 aa  358  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  28.05 
 
 
1148 aa  357  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  25.96 
 
 
1163 aa  356  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  29.42 
 
 
1122 aa  355  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  29.7 
 
 
1122 aa  353  8.999999999999999e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.31 
 
 
1160 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.04 
 
 
1158 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.42 
 
 
1160 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  29.79 
 
 
1132 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  30.86 
 
 
1132 aa  344  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.27 
 
 
1166 aa  344  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.77 
 
 
1157 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.26 
 
 
1159 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  30.94 
 
 
1171 aa  334  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.59 
 
 
1158 aa  331  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.05 
 
 
1098 aa  327  1e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.56 
 
 
1150 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.26 
 
 
1164 aa  322  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  31.24 
 
 
1156 aa  320  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.59 
 
 
1144 aa  318  5e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  26.99 
 
 
1127 aa  317  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.93 
 
 
1184 aa  313  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.17 
 
 
1173 aa  311  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.33 
 
 
1163 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.24 
 
 
1158 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4569  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.13 
 
 
1169 aa  304  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.89 
 
 
1198 aa  304  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.54 
 
 
1192 aa  303  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1613  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.11 
 
 
1124 aa  300  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0690  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.54 
 
 
1138 aa  295  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.52 
 
 
1197 aa  294  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4322  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  33.15 
 
 
1112 aa  294  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.65 
 
 
1206 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.03 
 
 
1162 aa  290  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.54 
 
 
1063 aa  290  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1749  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.29 
 
 
1121 aa  289  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246728  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  25.37 
 
 
1260 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.37 
 
 
1260 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2839  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.47 
 
 
1133 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601793  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.42 
 
 
1274 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.16 
 
 
1236 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.25 
 
 
1168 aa  278  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0520  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.73 
 
 
1174 aa  277  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.318804  normal  0.0360548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0734  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.19 
 
 
1112 aa  277  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1214  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  33.19 
 
 
1112 aa  277  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.3 
 
 
1234 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.75 
 
 
1270 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1187  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  32.95 
 
 
1112 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.720814  normal  0.579184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1385  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.55 
 
 
1114 aa  271  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1769.1  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.55 
 
 
1114 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0681  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.55 
 
 
1114 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0471  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.55 
 
 
1114 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0516412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1188  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.41 
 
 
1354 aa  270  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1389  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.44 
 
 
1197 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>