More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0242 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0242  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 322 aa  612  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3222  secretion protein HlyD  47.26 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.33 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4301  secretion protein HlyD  50.67 
 
 		 335 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4200  secretion protein HlyD  52.01 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  49.37 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  49.5 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  47.08 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  48.49 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  43.93 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0461  multidrug/cation efflux pump  43.64 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2114  RND family efflux transporter MFP subunit  43.64 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2474  RND family efflux transporter MFP subunit  37.72 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  44.07 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  37.58 
 
 		 357 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.469854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  27.55 
 
 		 375 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  27.45 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.32 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  26.33 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.37 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  30.46 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  25.32 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  28.42 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  22.15 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.18 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.16 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3761  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  28.75 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  25 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.01 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.59 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  24.87 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3743  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.12 
 
 		 426 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.12 
 
 		 426 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  23.23 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  24.74 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  29.41 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  25.7 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 401 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  25.08 
 
 		 444 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  27.55 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>