More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2383 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 332 aa  627  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2114  RND family efflux transporter MFP subunit  84.11 
 
 		 317 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0461  multidrug/cation efflux pump  83.8 
 
 		 317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  55.56 
 
 		 319 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  47.99 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  45.33 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3222  secretion protein HlyD  40.81 
 
 		 328 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  41.85 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4301  secretion protein HlyD  39.53 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0242  RND family efflux transporter MFP subunit  44.07 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  39.52 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4200  secretion protein HlyD  38.04 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2474  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  36.45 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.469854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  28.29 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  27.41 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.62 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  24.25 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  25.15 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.59 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  28.03 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.44 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.93 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  25.89 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  25.89 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  25.89 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.82 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  25.89 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  27.16 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  25.3 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  31.87 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  27.16 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  25.88 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  26.84 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.82 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  32.67 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  26.25 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  27.95 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.58 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.58 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  30.59 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  24.85 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.58 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.58 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  24.35 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.38 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.06 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  27.39 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  25.89 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  32 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  32 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  25.89 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  32 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  25.57 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  25.57 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.51 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3056  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.56 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  27.81 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  23 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  33.07 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>