More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2474 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2474  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 344 aa  658    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  47.26 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.469854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3222  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4301  secretion protein HlyD  39.93 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4200  secretion protein HlyD  41.18 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0242  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  39.34 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  37.66 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  39.41 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  36.27 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  34.09 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0461  multidrug/cation efflux pump  37.12 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2114  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.81 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.53 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  26.63 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  27.04 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  27.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.09 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  27.24 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3102  AcrA/AcrE family protein  26.42 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.49 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  33.52 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  35.56 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  28.3 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  28.3 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2869  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000418866  normal  0.697235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.29 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  35 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  25.76 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 422 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  26.56 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2794  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  28.42 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000223326  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  32.75 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  27.6 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  32.61 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  32.61 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.68 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  32.61 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3437  secretion protein HlyD family protein  29.93 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.319469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  25.89 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  34.65 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  29.36 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  32.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  32.07 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>