103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5010 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5010  response regulator receiver protein  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0917404  normal  0.10301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4550  GGDEF family protein  83.84 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5063  diguanylate cyclase  72.62 
 
 		 367 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2513  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5867  GGDEF  38.55 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2919  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.14 
 
 		 664 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5530  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 384 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.71 
 
 		 1079 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 380 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  37.97 
 
 		 494 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1813  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 386 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  39.51 
 
 		 398 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 374 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 261 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 1037 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  37.18 
 
 		 494 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2160  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 732 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2222  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 732 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.0596169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  31.96 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 380 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  32.93 
 
 		 565 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  32.56 
 
 		 360 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1313  diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 543 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1910  GGDEF family protein  36.36 
 
 		 413 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2545  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 301 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 498 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1290  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 491 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 1099 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3192  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 627 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 507 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3763  GGDEF  33.72 
 
 		 358 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  35.63 
 
 		 502 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2407  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.85 
 
 		 443 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0296488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3230  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35 
 
 		 872 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 532 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  31.33 
 
 		 554 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1616  GGDEF domain protein  33.72 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.515769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 591 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  30.68 
 
 		 1826 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2010  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3563  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 		 312 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  34.94 
 
 		 646 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5582  diguanylate cyclase  38 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 		 684 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1311  hypothetical protein  32.1 
 
 		 792 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1308  hypothetical protein  32.1 
 
 		 792 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.21 
 
 		 843 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  31.65 
 
 		 555 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.8 
 
 		 757 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1723  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.96 
 
 		 733 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  28.89 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 387 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 345 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1334  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.23 
 
 		 447 aa  42  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2153  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 443 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0754  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 463 aa  42  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1372  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.738866  normal  0.941955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 346 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0679  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 684 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3754  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 512 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 312 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 532 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0266  GGDEF  32.22 
 
 		 690 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 		 565 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0636  diguanylate cyclase  35.63 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3428  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 425 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3178  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 452 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0366604  hitchhiker  0.0000463802 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  27.59 
 
 		 413 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  38.46 
 
 		 425 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 487 aa  40.8  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3423  GGDEF domain-containing protein  31.25 
 
 		 325 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  35.23 
 
 		 494 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3580  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.71 
 
 		 873 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0147  membrane associated GGDEF protein  32.53 
 
 		 487 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3136  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.35 
 
 		 700 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.882621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2546  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 452 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3160  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 452 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.413104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  31.33 
 
 		 513 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2732  diguanylate cyclase  29.55 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  29.49 
 
 		 512 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  33.75 
 
 		 524 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0754  diguanylate cyclase  32.94 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2279  diguanylate cyclase  26.83 
 
 		 467 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2147  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.56 
 
 		 410 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.83 
 
 		 663 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0577  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 378 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.299123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1499  response regulator/GGDEF domain protein  32.95 
 
 		 334 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 333 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0077  diguanylate cyclase  30.69 
 
 		 411 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.03 
 
 		 951 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 377 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1114  diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3193  diguanylate cyclase  28.05 
 
 		 627 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  29.89 
 
 		 523 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 714 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>