257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0803 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0803  ROK family protein  100 
 
 		 374 aa  729    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10493  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0087  ROK family protein  45.95 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0656  ROK domain-containing protein  44.76 
 
 		 436 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0669  ROK family protein  44.76 
 
 		 436 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0649  ROK family protein  44.76 
 
 		 436 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0218  ROK family protein  40.1 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4513  ROK family protein  40.31 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0826  ROK family protein  43.39 
 
 		 437 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  36.43 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  32.89 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  34.59 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  32.28 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.18 
 
 		 410 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  30.16 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.27 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  33.61 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.09 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  25.67 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.28 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.19 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.29 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.64 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  25.75 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  27.94 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.93 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.8 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  33.33 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.84 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  27.5 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  25.87 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  21.51 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  21.41 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.89 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.36 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.54 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  19.53 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  26.27 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  28.69 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  23.33 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.33 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  23.56 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  30.19 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.2 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.3 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  28.35 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  24.58 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  28.42 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  31.72 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  22.19 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.94 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.88 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  31.84 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.35 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  28.17 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.59 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.49 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  26.07 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  25.74 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  25.85 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  21.31 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  24.02 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  19.51 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  29.69 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  25.32 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  27 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.77 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  23.87 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  29.84 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  28.57 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.28 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  19.66 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.67 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.36 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.87 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  33.49 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.85 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  26.15 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  26.36 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  23.29 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  31.97 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  30.47 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.75 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  24.62 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  23.32 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  27.51 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.44 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  24.75 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.46 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  23.4 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.69 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  24.75 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.34 
 
 		 443 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.69 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.75 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  26.87 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.75 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>