More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 396 aa  776    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  42.06 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0087  ROK family protein  42.12 
 
 		 440 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10493  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0656  ROK domain-containing protein  40.38 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0669  ROK family protein  40.38 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0649  ROK family protein  40.38 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  38.74 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0218  ROK family protein  41.37 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4513  ROK family protein  40.05 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  39.88 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0826  ROK family protein  39.38 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0803  ROK family protein  36.43 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.06 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.13 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.76 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  34.23 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  27.43 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.89 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.85 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.63 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  27.58 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  27.3 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.51 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.33 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.74 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.14 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.87 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.49 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  27.37 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  27.37 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.83 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.68 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.68 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.68 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.68 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.68 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.12 
 
 		 399 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  28.12 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.75 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.07 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  27.14 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.35 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  28.18 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.53 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.93 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  24.86 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.13 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.02 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.48 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  21.99 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.76 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.27 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.58 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.95 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.87 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  32.77 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.54 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  30.4 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  27.2 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  27.2 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  32.39 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.59 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  32.69 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  27.2 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.74 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.61 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.51 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  31.44 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  26.91 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.45 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.35 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.15 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  30.19 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  26.91 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  30.97 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.14 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  30.23 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.94 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.88 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.15 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  23.3 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.72 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  25.83 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.93 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.88 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  26.98 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.66 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.47 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.41 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>