More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10493 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10493  transcriptional regulator  100 
 
 		 438 aa  860    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0087  ROK family protein  69.34 
 
 		 440 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0656  ROK domain-containing protein  72.97 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0669  ROK family protein  72.97 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0649  ROK family protein  72.97 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0826  ROK family protein  69.17 
 
 		 437 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4513  ROK family protein  48.27 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0218  ROK family protein  47.26 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0803  ROK family protein  44.33 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  41.56 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  32.17 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  34.3 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  30.49 
 
 		 466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.73 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  26.59 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.37 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.19 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.82 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  26.36 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  32.43 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  24.92 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.43 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  26.33 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.58 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  23.5 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  24.7 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  29.45 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.08 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.55 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  22.04 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.67 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.97 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  28.72 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.78 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  22.63 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  23.74 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  23.74 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.14 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  23.49 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.27 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.27 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.27 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
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NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  25.6 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  24.27 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  27.67 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.61 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  23.87 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  25.07 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.53 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  23.87 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  23.87 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  23.55 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.63 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.74 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  29.5 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  23.98 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.59 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.35 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.61 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  24.1 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  30.42 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.04 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  21.85 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  21.85 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  21.85 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  21.85 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  21.85 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  25 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  30.42 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  22.59 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  29.97 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.23 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.86 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  27.62 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.93 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.4 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  25.13 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  26.46 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  25.13 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  26.98 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  28.18 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.74 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.09 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.31 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  30.54 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  22.87 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  22.87 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  22.87 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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