More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0649 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0656  ROK domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0669  ROK family protein  100 
 
 		 436 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0649  ROK family protein  100 
 
 		 436 aa  842    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0087  ROK family protein  79.42 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0826  ROK family protein  74.89 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10493  transcriptional regulator  72.97 
 
 		 438 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4513  ROK family protein  49.87 
 
 		 396 aa  326  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0218  ROK family protein  45.26 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0803  ROK family protein  44.76 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  40.31 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  34.81 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  33.42 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  31.95 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.53 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.49 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.58 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.25 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.77 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  30.85 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.41 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.4 
 
 		 401 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.79 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  30.49 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.86 
 
 		 414 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.67 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  23.89 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  27.44 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  30.08 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  23.74 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  23.64 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  22.62 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  21.11 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  26.5 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  21.53 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.37 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  22.52 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  21.09 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.45 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  28.4 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.76 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.4 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  21.07 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.55 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  24.94 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  29.28 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.74 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.3 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  28.21 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  22.63 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  21.91 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.15 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  22.37 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  21.26 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.64 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  21.26 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  21.26 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.76 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  21.45 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.22 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.78 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  22.22 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  23.1 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.47 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.94 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.18 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.25 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.19 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  22.94 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.81 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.5 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  29.18 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.15 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  25.74 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  27.46 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  27.89 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  20.23 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  20.99 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  20.99 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  20.99 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  20.99 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  20.99 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  22.02 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  28.25 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  27.24 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  25.92 
 
 		 417 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.46 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  28.18 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  25.47 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  19.95 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  22.26 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  27.69 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>