More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3774 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  100 
 
 		 416 aa  810    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  49.47 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  43.98 
 
 		 429 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  38.74 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0087  ROK family protein  32.89 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0656  ROK domain-containing protein  33.77 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0669  ROK family protein  33.77 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0649  ROK family protein  33.77 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.4 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10493  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0218  ROK family protein  32.64 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.34 
 
 		 409 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0826  ROK family protein  32.82 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.17 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  27.96 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0803  ROK family protein  32.72 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.4 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.23 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  26.2 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  30.82 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.28 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  26.69 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.05 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  25.94 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.18 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.14 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4513  ROK family protein  29.04 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.12 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  27.49 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.69 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  23.12 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  25.86 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  28.85 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  19.29 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.23 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  32.05 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  25.44 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  25.44 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  25.44 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  19.95 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  25.68 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.48 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  25.68 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  25.44 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  25.44 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.47 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.61 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  24.62 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  24.62 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.14 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.08 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  24.87 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.32 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.48 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.94 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  21.3 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  23.08 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  25.5 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  24.01 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  24.01 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  24.01 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  24.01 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  24.01 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  27.34 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  30.43 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  22.19 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  24.01 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.7 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  25.94 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4939  ROK family protein  26.58 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  22.68 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.63 
 
 		 352 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  27.38 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.86 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  26.38 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.37 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  25.35 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  27.27 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  31.2 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  23.93 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.33 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.87 
 
 		 389 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  21.47 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  21.24 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.68 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  25.45 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  22.11 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  24.37 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  25.79 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  24.53 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.62 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.3 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  23.34 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.14 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  21.47 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  20.06 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.25 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.25 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  21 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>