83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3007 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  100 
 
 		 408 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  43.04 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  44.21 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  44.74 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  44.21 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  44.21 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  44.21 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  44.21 
 
 		 390 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  43.95 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  43.68 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  42.74 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  42.74 
 
 		 390 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  50.26 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  50.25 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  49.49 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  50.66 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  47.68 
 
 		 407 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  48.08 
 
 		 403 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  48.21 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.83 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  49.62 
 
 		 395 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  47.49 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  52.37 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  48.59 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  46.75 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  48.21 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  47.03 
 
 		 411 aa  279  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  45.55 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  43.99 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  50.65 
 
 		 427 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  45.09 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  49.35 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  42.86 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.35 
 
 		 345 aa  239  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.84 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  23.54 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.44 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.45 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.6 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  24.15 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  23.31 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  27 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.46 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.26 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.53 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.38 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.14 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.15 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.9 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  25 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.67 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.1 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  24.4 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  24.9 
 
 		 349 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  22.76 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  25.43 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.88 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  24.39 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  24.03 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  26.9 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  23.41 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  26.19 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  26.64 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1355  hypothetical protein  30.67 
 
 		 83 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.25 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  24.9 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  23.02 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  23.87 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  27.41 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  25.29 
 
 		 355 aa  46.6  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  25.29 
 
 		 355 aa  46.6  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  23.76 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  25.61 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  25.64 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  26.6 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  21.81 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  23.89 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  25.2 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  26.05 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  23.37 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  25.63 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  28.24 
 
 		 375 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>