75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0956 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 391 aa  767    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  76.07 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  64.9 
 
 		 407 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  66.75 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  62.41 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  60.75 
 
 		 444 aa  454  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  61.92 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  60 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  56.74 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  57.92 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  58.52 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  56.09 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  57 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  56.82 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  56.06 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  53.33 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  50.13 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  54.5 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  50.99 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  50.13 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  50.66 
 
 		 408 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  48.24 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  43.31 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  42.86 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  42.35 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  42.35 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  41.58 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  42.35 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  42.09 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  42.09 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  42.03 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  41.58 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  41.33 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.78 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.45 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  26.63 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  28.87 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  25.57 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  27.76 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  25.96 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.08 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  23.87 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  26.48 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  26.91 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.43 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  27.14 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.59 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  24.43 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  26.56 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.28 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  28.1 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.85 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  24.01 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.63 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.88 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  25.26 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  25.26 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.03 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.27 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  22.44 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  27.76 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  27.19 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.19 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  24.15 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  28.19 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  37.61 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.44 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  27.09 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  26.18 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.28 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  29.26 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  30.32 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  29.63 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  26.18 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.32 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>