36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2495 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  80.47 
 
 		 425 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  81.09 
 
 		 402 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  100 
 
 		 427 aa  878    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  43.38 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  43.78 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  36.87 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  24.63 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  24.88 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  23.87 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  23.73 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  23.96 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  21.29 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  24.94 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  22.83 
 
 		 444 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  22.08 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  21.27 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.72 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  21.04 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.85 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  22.03 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  26.48 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  20.25 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  20.94 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.33 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  21.89 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  24.49 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  21.89 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  23.29 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  22.65 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  22.07 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  21.64 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  21.3 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  21.37 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  21.64 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  24.49 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  20.33 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>